La historia del FC Admira Wacker es la historia de dos antiguos clubes rivales de Viena cuyos destinos no se entrelazaron hasta 1971. El SK Admira se fundó el 17 de junio de 1905 en el barrio obrero de Jedlesee, a partir de la fusión de dos asociaciones más pequeñas, mientras que el SC Wacker se creó en 1907 en otra zona de Viena, Obermeidling. Ambos clubes se desarrollaron por separado durante décadas hasta que, en 1971, ante problemas financieros y el descenso del Wacker, ambos unieron fuerzas para formar el FC Admira/Wacker Viena, entidad que se convirtió en el sucesor legal de ambos predecesores, heredando su palmarés combinado.
Fue el Admira de la preguerra el que se contó entre los clubes más fuertes de la Europa Central de entreguerras, y su episodio más extraordinario sigue siendo el breve pero fructífero paso de Josef Bican, delantero considerado hoy por muchos estadísticos el máximo goleador de la historia del fútbol. Bican se incorporó al club en el verano de 1935 tras un amargo conflicto contractual con el Rapid de Viena, y pasó dos temporadas en el Admira (1935-36 y 1936-37), ayudando a conquistar dos campeonatos austríacos consecutivos, antes de trasladarse al Slavia de Praga a comienzos de 1937, donde su fenomenal talento goleador alcanzó por fin su plenitud. Un año antes, en 1934, el Admira también había alcanzado la final de la Copa de Europa Central (Mitropa Cup), cayendo en la eliminatoria a doble partido ante el Bologna italiano por 4-7 en el global, pese a haber ganado 3-2 la ida disputada en Viena.
En total, el SK Admira conquistó ocho campeonatos austríacos y cinco Copas de Austria a lo largo de su historia, mientras que el SC Wacker podía presumir de un título de liga y un triunfo copero, un palmarés combinado que pasó al club fusionado. Tras años de inestabilidad deportiva y una nueva fusión, esta vez en 1997 con el VfB Mödling, de una localidad cercana, se formó el actual FC Admira Wacker Mödling, con su sede trasladada al distrito de Südstadt, en Maria Enzersdorf. El club unificado logró su mayor éxito europeo en 1990, al alcanzar los cuartos de final de la Recopa de Europa de la UEFA.
Hoy, el Admira disputa sus partidos en el estadio construido específicamente en Südstadt entre 1965 y 1967, con capacidad para unos 10.600 espectadores, actualmente conocido como Datenpol Arena. Tras años alternando entre la máxima categoría y la 2. Liga, el club compite en la segunda división austríaca desde la temporada 2023-24, manteniendo viva la herencia de dos clubes de la capital que en su día se contaron entre la élite del fútbol centroeuropeo.