«Ислочь» получила своё название от реки, а не от города. Клуб был основан в 2007 году в деревне Новоселье Минского района из желания местной молодёжи участвовать в чемпионате района и назван по реке Ислочь, протекающей по территории района. Как футбольный клуб он был зарегистрирован в 2011 году. Официально команда представляет Минский район, но домашние матчи проводит в столице, на стадионе «Минск» вместимостью около 3000 зрителей, а её цвета — серо-синие.
Продвижение было быстрым. «Ислочь» начинала с третьего дивизиона Минской лиги футбола, который выиграла в дебютном сезоне, потерпев лишь одно поражение в 20 играх, а также завоевала кубок лиги. Затем она стала второй в чемпионате области и выиграла как Кубок области, так и Региональный кубок страны, что дало право участвовать в отборочном раунде Кубка регионов УЕФА. В 2012 году клуб дебютировал во второй лиге Беларуси и занял третье место, что открыло путь в первую лигу, а в июне 2013 года дошёл до финальной стадии Кубка регионов УЕФА, где, по данным Белорусской федерации футбола, стал бронзовым призёром. В 2015 году «Ислочь» выиграла первую лигу и впервые в истории вышла в высшую лигу, где выступает с 2016 года. С 2010 года до конца 2020 года командой руководил тренер Виталий Жуковский.
В высшем дивизионе «Ислочь» быстро стала крепким середняком. В 2018 году она заняла 10-е место, в 2019-м — 5-е, при этом лучшим бомбардиром стал гвинейский нападающий Момо Янсане с 11 голами, в 2020-м — 7-е. Сезон 2018/19 принёс также первый в истории клуба полуфинал Кубка Беларуси, в который команда вышла, обыграв в четвертьфинале БАТЭ Борисов. Самый большой день в истории клуба пришёлся на 2021 год, когда «Ислочь» впервые вышла в финал Кубка Беларуси 2020/21, что сам клуб называет историческим достижением для команды из Минского района. Финал она проиграла БАТЭ 1:2, лишившись и трофея, и места в еврокубках. Нападающий Дмитрий Комаровский был лучшим бомбардиром клуба в 2018 и 2021 годах, оба раза с восемью голами.
Идентичность клуба опирается на местные корни не меньше, чем на результаты. В марте 2017 года была создана футбольная школа, носящая имя клуба, с целью воспитания игроков из Минского района, и к 2021 году одиннадцать её воспитанников дебютировали в высшей лиге, первый из них в 2017 году. Лучший результат «Ислочи» в чемпионате на сегодня — четвёртое место в 2023 году, а в сезоне 2023/24 клуб дошёл до второго финала Кубка Беларуси. В 2025 году он занял седьмое место среди 16 команд.
История «Ислочи» — это история быстрого роста от деревенской команды до постоянного участника высшего дивизиона менее чем за десятилетие, без длинной истории за спиной. Клуб не выигрывал крупных трофеев, но два финала кубка, бронза Кубка регионов и место среди сильнейших белорусских клубов обеспечивают ему прочное положение на футбольной карте страны.