«Маритиму» начинал как клуб портовых рабочих и моряков. По имеющимся данным, он был основан 20 сентября 1910 года в Фуншале Кандиду Фернандешем де Гувеей под названием «Клуб Португеш де Спорт Маритиму». Он создавался в том числе для матчей с командами моряков с судов, заходивших в порт Мадейры, и в городе с сильным английским влиянием противопоставлял себя более старым соперникам аристократического характера. Рабочие корни и подчёркнуто португальская идентичность остаются важной частью образа клуба и сегодня.
Самый старый трофей клуба относится ко времени, когда общенационального чемпионата ещё не существовало. В 1926 году «Маритиму» выиграл Чемпионат Португалии — первое общенациональное соревнование, проводившееся по кубковой системе с приглашением победителей региональных лиг. На некоторое время он стал лучшей командой страны. В его составе играл один из первых португальских нападающих высокого уровня Артур де Соза по прозвищу Пинга. Клубы с островов начали участвовать в Кубке Португалии с сезона 1938/39, а расстояние до материка сильно осложняло соревнования. В высший дивизион «Маритиму» впервые вышел в сезоне 1977/78.
Переломным стал период 1990-х, когда в 1990 году команду возглавил молодой бразильский тренер Паулу Аутуори. В сезоне 1992/93 клуб первым с Мадейры квалифицировался в еврокубки. Дебют в Кубке УЕФА состоялся 15 сентября 1993 года в Антверпене, где команда проиграла 0:2. Ещё значительнее стал сезон 1994/95: «Маритиму» впервые в истории вышел в финал Кубка Португалии, выбив в полуфинале «Порту» (1:0), и 10 июня 1995 года на «Жамору» уступил «Спортингу» 0:2. В том же сезоне в Кубке УЕФА он встретился с «Ювентусом», который выиграл по сумме двух матчей 3:1, причём все три гола забил Фабрицио Раванелли.
В последующие годы клуб девять раз выступал в Кубке УЕФА или Лиге Европы. На старом стадионе «Барейруш» играли, среди прочих, «Ювентус», «Лидс Юнайтед», «Ньюкасл Юнайтед», «Валенсия» и «Рейнджерс». Расстояние между Мадейрой и материком делало поездку в Фуншал утомительной даже для больших команд. Всего «Маритиму» провёл 43 сезона в высшем дивизионе, что ставит его в первую десятку вечной таблицы, дважды был финалистом Кубка Португалии и дважды — финалистом Кубка лиги.
Сердцем клуба остаётся стадион «Барейруш», открытый 26 июня 1927 года. Много лет он делил его с «Насьоналом», а по данным путеводителей, на нём порой играли все три клуба Фуншала. После масштабной реконструкции в 2016 году арена получила название «Эштадиу ду Маритиму», но её историческое имя по-прежнему живёт среди болельщиков. Хозяева обычно играют при почти полных трибунах, так как гостевых болельщиков мало. Исключение — «Дерби Мадейры» с «Насьоналом», основанным в том же 1910 году, остающееся самым горячим событием сезона на острове.
Зелёно-красные цвета, официальные с момента основания клуба, дали ему прозвище «Ош Верде-Рубруш», а о положении в регионе говорит эпитет «О Майор даш Илхаш» («Крупнейший из островов»). В сезоне 2025/26 команда выиграла Лигу Португал 2 и заняла первое место, подтвердив способность возвращаться. «Маритиму» остаётся клубом, который уже более века представляет Мадейру на футбольной карте Португалии и Европы.