FC Red Bull Salzburg powstał 13 września 1933 roku pod nazwą SV Austria Salzburg, z fuzji dwóch miejscowych klubów – Herthy i Rapidu Salzburg. Zanim jednak stał się jednym z najbardziej rozpoznawalnych projektów w nowoczesnym futbolu europejskim, klub przez dekady zmieniał nazwę wraz ze zmieniającymi się sponsorami – od SV Casino Salzburg w 1978 roku po SV Wüstenrot Salzburg w 1997 roku – a swój pierwszy w historii tytuł mistrzowski zdobył dopiero w 1994 roku.
Ten sam rok przyniósł klubowi jego największy jak dotąd sukces europejski – awans do finału Pucharu UEFA. W dwumeczu z włoskim Interem Mediolan Salzburg, ówcześnie występujący jeszcze jako Austria Salzburg, dwukrotnie przegrał 0:1, tracąc trofeum minimalnym bilansem 0:2. Mimo porażki, występ ten na trwałe zapisał miasto w annałach europejskich rozgrywek, a finansowe wpływy z pucharowej kampanii pozwoliły klubowi ustabilizować sytuację i w kolejnych latach (1995, 1997) zdobyć jeszcze dwa mistrzostwa Austrii.
Przełomowy moment nastąpił w 2005 roku, gdy klub przejął koncern Red Bull, zmieniając nazwę na obecną i wprowadzając zupełnie nowy model zarządzania. Od tego czasu Salzburg zdobył 17 tytułów mistrzowskich oraz 9 Pucharów Austrii – w tym dziesięć mistrzostw z rzędu w latach 2014–2023, serię dominacji bez precedensu w historii austriackiej ligi. Czerwono-biali regularnie występują w Lidze Mistrzów i Lidze Europy, a Red Bull Arena w Salzburgu była świadkiem wielu pamiętnych wieczorów, w tym zwycięstw nad Bayernem Monachium czy emocjonujących pojedynków z Realem Madryt i Liverpoolem.
Dziś Red Bull Salzburg jest jednak przede wszystkim globalną fabryką talentów. Klub łączy wyśmienity skauting z nowoczesnym modelem rozwoju młodzieży – Sadio Mané trafił tu z francuskiego Metz w 2012 roku i w niespełna trzy sezony, strzelając 45 goli w 87 meczach, wywalczył sobie transfer do Southamptonu; Erling Haaland zadebiutował w Lidze Mistrzów hat-trickiem przeciwko belgijskiemu Genk w 2019 roku, zanim rok później trafił do Borussii Dortmund; a węgierski pomocnik Dominik Szoboszlai po latach gry u boku Haalanda przeniósł się na początku 2021 roku do siostrzanego klubu RB Lipsk. Dzięki temu modelowi Salzburg nie tylko przez dekadę dominował w Austrii, choć w sezonie 2025/2026 ustąpił miejsca rywalom w krajowej tabeli, ale też stale wpływa na oblicze europejskiego futbolu, udowadniając, że połączenie biznesu, infrastruktury i pracy z młodzieżą potrafi stworzyć trwałą markę na Starym Kontynencie.