У «Рандерса» нет даты основания в XIX веке, но у него есть история старше его возраста: он был образован 1 января 2003 года как сотрудничество шести местных клубов — «Доннингборг» (основан в 1928 году), «Хорнбек» (1945), «Криструп» (1908), «Рандерс Фрея» (1898), «Рандерс КФУМ» (1920) и «Вору Фредериксберг» (1930). Профессиональная команда продолжила выступать по лицензии «Фреи» — клуба, который трижды выигрывал Кубок Дании и в сезоне 1968/69 дошёл до четвертьфинала Кубка обладателей кубков. Новый клуб стартовал в сезоне 2003/04 во втором дивизионе, но с традицией, уходящей более чем на столетие.
Эмблема, созданная в январе 2003 года, изображает синего коня. Она отсылает к большой скульптуре коня в центре Рандерса, стоящей там около тридцати лет и ставшей неофициальным символом города, и объясняет прозвище Hestene — «Лошади». Клуб с востока Ютландии остаётся близок к местным корням. Исследование датской прессы однажды поставило его бюджет в тройку самых маленьких в Суперлиге, что делает результаты последних двух десятилетий ещё более примечательными.
Первый большой успех пришёл очень быстро. В сезоне 2005/06 «Рандерс» вернулся в Суперлигу с 61 очком, а 11 мая 2006 года на стадионе «Паркен» в Копенгагене ещё и выиграл Кубок Дании, победив в финале «Эсбьерг» 1:0. Это первая команда с 1974 года, выигравшая кубок, выступая во втором дивизионе. Это дало место в Кубке УЕФА 2006/07, где «Рандерс» прошёл команды из Исландии и Литвы в двух квалификационных раундах, а затем в первом раунде встретился с «Фенербахче» и проиграл по сумме двух матчей 1:5. Тот же сезон завершился ничьей 3:3 в гостях у чемпиона «Копенгагена» и пятым местом в лиге — лучшим в первые годы клуба.
Европейский футбол возвращался в Рандерс несколько раз: в сезонах 2009/10 и 2010/11 благодаря рейтингу честной игры и в 2015/16, когда клуб выбыл во втором квалификационном раунде. В лиге лучшее место было занято в 2013 году, когда «Рандерс» стал третьим, а также дошёл до финала кубка, хотя и проиграл его. В 2010 году он лишь едва избежал вылета после драматической борьбы внизу таблицы. Бывший защитник сборной Англии Колин Тодд, когда-то тренировавший клуб, — одно из самых известных имён на его скамейке.
Второй Кубок Дании пришёл 13 мая 2021 года после победы над «Сённерюске» в финале, сыгранном вне традиционного места в Копенгагене. Под руководством тренера Томаса Томасберга «Рандерс» проиграл стыковой матч Лиги Европы «Галатасараю» по сумме двух встреч 2:3 — совсем немного не хватило — и впервые в своей истории вышел в групповой этап европейского турнира, в только что созданной Лиге конференций. Он занял второе место в группе D позади «АЗ» и впереди «Яблонца» и «КФР Клуж», а в стыковых матчах плей-офф уступил «Лестер Сити». Домашний стадион, исторически известный как «Рандерс Стадион» и сегодня носящий коммерческое название, вмещает около 12 тысяч зрителей, а клуб остаётся постоянным участником датской Суперлиги — примером того, как объединение шести клубов может создать прочную команду высшего дивизиона.