FC AarauWe wrześniu 1993 roku, kilka miesięcy po zdobyciu mistrzostwa Szwajcarii, FC Aarau zmierzyło się z AC Milan w pierwszej rundzie Ligi Mistrzów. Mistrz Szwajcarii przegrał u siebie 0:1 i zremisował 0:0 na wyjeździe, odpadając z jednobramkową stratą w dwumeczu. Dla klubu z niewielkiego miasta był to szczyt dekady, w której Aarau pod wodzą trenera Rolfa Fringera zdobyło trzeci i ostatni tytuł mistrzowski, po tych z 1912 i 1914 roku.
Klub założyli 26 maja 1902 roku pracownicy lokalnego browaru w Aarau, stolicy kantonu Argowia. Wczesne sukcesy przyszły szybko: Aarau było mistrzem Szwajcarii w 1912 i ponownie w 1914 roku. Potem minęło niemal osiem dekad do trzeciego tytułu. W międzyczasie klub zasłynął ze swojego stadionu, Brügglifeld, na którym gra od 1924 roku. Obiekt obchodził 100. rocznicę 12 października 2024 roku meczem ze Schalke 04 i niewiele się zmienił, poza trybuną główną, która pochodzi z 1982 roku. Mieści około 8 tysięcy widzów, a mecz pucharowy z Luzern zgromadził komplet 8450 osób, co uchodzi za dużą frekwencję jak na ten stadion.
Lata osiemdziesiąte przyniosły drugie ważne trofeum. W 1985 roku pod wodzą trenera Ottmara Hitzfelda Aarau wygrało Puchar Szwajcarii, co do dziś jest jedynym zwycięstwem klubu w tych rozgrywkach. Klub był finalistą w 1930 roku i ponownie w 1989. Triumf w pucharze dał miejsce w Pucharze Zdobywców Pucharów 1985/86, w którym Aarau przegrało pierwszą rundę z Crveną zvezdą 2:4 w dwumeczu, po porażce 0:2 na wyjeździe i remisie 2:2 u siebie. W sezonie 1988/89 klub zagrał w pierwszej rundzie Pucharu UEFA, a w 1994 roku przeszedł rundę kwalifikacyjną z Murą ze Słowenii, wygrywając oba mecze 1:0.
Od 1981 do 2010 roku klub był nieprzerwanie członkiem szwajcarskiej ekstraklasy, tak wytrwałym, że kibice nazywali go klubem nie do zdegradowania. Ta passa skończyła się spadkiem w 2010 roku. Aarau wróciło do Super League w 2013 roku, ale spadło ponownie w 2015, i od tamtej pory próby powrotu często kończyły się porażkami, raz w dramatycznym barażu z Xamaxem. Zamiast dawnego przydomka kibice zaczęli mówić o klubie nie do awansowania, choć stadion nadal wypełnia się na duże mecze, a w 2025/26 zespół zajął drugie miejsce w Challenge League.
Obecna tożsamość klubu, który gra w czerwono-białych barwach, opiera się na tym kontraście. Dorobek Aarau jest skromny liczebnie, trzy mistrzostwa i jeden puchar, ale obejmuje okres ponad wieku, a sezon 1993, gdy klub z małego miasta dotarł do Ligi Mistrzów, nadal określa, jak kibice widzą drużynę. W 1985 i w 1993 roku klub prowadzili dwaj trenerzy, Hitzfeld i Fringer, którzy później stali się bardziej znani gdzie indziej, a pamięć o tamtych latach jest jednym z głównych atutów klubu. Brügglifeld, prosty i staromodny obiekt, pozostaje dla wielu szwajcarskich kibiców miejscem przypominającym inną epokę futbolu.