El Ferencvárosi Torna Club, fundado en Budapest el 3 de mayo de 1899 por Ferenc Springer y un grupo de vecinos del noveno distrito, se reconoce mejor a través de los símbolos de su escudo. Las nueve franjas (cinco verdes y cuatro blancas) remiten al número del distrito de Ferencváros, y las tres letras E representan el lema del club: Erkölcs, Erő, Egyetértés (Moralidad, Fuerza, Entendimiento). Sus colores son el verde y el blanco, y su mascota es un águila verde. El apodo Fradi procede del nombre alemán del distrito, Franzstadt.
La sección de fútbol se creó el 3 de diciembre de 1900 y el club ganó su primer campeonato húngaro en 1903. De aquella temporada data la rivalidad con el MTK Budapest, conocida como el "Örökrangadó" (Derbi Eterno) y considerada la más antigua de Hungría. El 12 de febrero de 1911 el Ferencváros inauguró su estadio en la calle Üllői, donde Imre Schlosser marcó el primer gol. En 1912 Schlosser anotó ocho goles en un solo partido (11-3 ante un equipo del distrito III), lo que sigue siendo un récord del club. Antes de la guerra el club ganó también la Copa Mitropa (1928 y 1937). Tras la guerra las autoridades comunistas lo trataron con recelo: entre 1950 y 1956 jugó como ÉDOSZ SE y luego como Kinizsi, se le cambiaron los colores, y tras el título de 1948/49 el siguiente no llegó hasta 1962/63. Después de la revolución de 1956 el club recuperó su nombre y sus colores.
La edad de oro de los años sesenta se asocia a Flórián Albert, el único húngaro ganador del Balón de Oro (1967). Albert disputó 351 partidos con el club y marcó 256 goles. Junto a jugadores como Máté Fenyvesi, Sándor Mátrai o Gyula Rákosi, llevó al equipo a los títulos de 1962/63, 1964, 1967 y 1968. El máximo goleador histórico del club es, sin embargo, György Sárosi (351 goles entre 1931 y 1948), y el jugador con más partidos es Péter Lipcsei (428).
En el plano internacional, el Ferencváros sigue siendo el único club húngaro que ha ganado un gran título europeo. El 23 de junio de 1965 en Turín venció a la Juventus por 1-0 en la final de la Copa de Ferias, en el campo del rival y ante 40.000 espectadores. Los italianos jugaron sin dos piezas clave, Omar Sivori y Sandro Salvadore. El club disputó otra final de esa competición en 1968, en la que perdió ante el Leeds United, y en 1975 llegó a la final de la Recopa de Europa, donde cayó por 3-0 ante el Dinamo de Kiev.
En 1995/96 el Ferencváros se convirtió en el primer club húngaro en llegar a la fase de grupos de la renovada Liga de Campeones, tras eliminar al Anderlecht (1-0 a domicilio y 1-1 en casa). En un grupo con el Ajax, el Real Madrid y el Grasshoppers acabó tercero con 5 puntos, y su resultado más recordado fue el 3-0 en Zúrich. Tras el año 2000 el club atravesó una crisis: en 2006 la federación le retiró la licencia (decisión que después se consideró ilegítima) y el Ferencváros pasó tres temporadas fuera de la máxima categoría. Ganó la segunda división en 2008/09 y volvió a la élite.
La etapa moderna es, sobre todo, una racha ininterrumpida de siete campeonatos entre 2018/19 y 2024/25, conquistados con sucesivos entrenadores, desde Serhiy Rebrov hasta Robbie Keane, que se hizo cargo del equipo en enero de 2025. El club jugó fases de grupos de la Liga Europa (2019/20 y 2021/22) y de la Liga de Campeones (2020/21), y en 2025/26 alcanzó los octavos de final de la Liga Europa, donde fue eliminado por el Braga. La racha de títulos terminó en mayo de 2026, cuando el Győri ETO ganó la liga con un punto más que el Ferencváros. El club conquistó, sin embargo, la Copa de Hungría tras la final contra el Zalaegerszeg, su 25.º triunfo en la competición.
En total, el Ferencváros suma 36 campeonatos nacionales, 25 Copas de Hungría y seis Supercopas, y es el máximo ganador en cada una de estas categorías. Desde 2014 juega en un nuevo estadio, construido entre 2013 y 2014 en el lugar del anterior recinto de la calle Üllői, que desde 2007 llevaba el nombre de Flórián Albert. Se inauguró el 10 de agosto de 2014 con un partido contra el Chelsea.